Ezek közül az egyiknél úgy döntenek, hogy a program kvázi lelepleződése miatt fel kell számolni a többi, hasonló kémkiképző projektet is, hiszen „Jason Bourne csak a jéghegy csúcsa”. A sort a Végeredmény program résztvevőivel, azaz ügynökeivel és a kutatásban dolgozó orvosokkal kezdik, így talál egymásra a küzdelemben Aaron Cross, egy Bourne-hoz hasonló gyilkológép és szuperkém egy személyben és Marta Shearing, egy gyógyszercég kutatója, akik együtt veszik fel a harcot a titokzatos ügynökség ellen, saját életben maradásukért.
 
A Bourne hagyatékot a korábbi két részt jegyző Paul Greengrass helyett az a Tony Gilroy rendezte, akinek nevéhez a trilógia (A Bourne-rejtély, 2002; A Bourne-csapda, 2004; A Bourne-ultimátum, 2007) forgatókönyveinek megírása fűződik. A direktor- és főszereplőváltással pedig formailag és hangulatilag is megváltozott az aktuális részre a Bourne-filmek világa. Sokkal elegánsabb, letisztultabb lett, nem rángatják például elmebeteg módon a kamerát és vágják a snitteket, ehelyett kifejezetten feltűnő az akciójelenetek alacsony száma (talán ha öt van a filmben, és ezek közül is csak egyetlen igazán monstre), és az egész az előzmények helyett sokkal inkább emlékeztet az olyan hetvenes évekbeli paranoia-filmekre, mint például A Keselyű három napja.